企业选定了战略合作伙伴，并达成了合作协议，这还只是完成了前期工作，而后期的“管理合作伙伴关系”工作更显艰巨。合作伙伴关系管理的重点不是“伙伴”，而是“关系”，即如何才能让“关系”更加持久，如何才能让“合作”给企业带来更多的回报。

　　首先，企业要明确对合作伙伴关系的维护，是为了共同做大市场蛋糕，争得更大的市场占有率，给合作各方带来比独自奋战更多的利润。在此基础上，收益分配应当遵循“双赢”或“共赢”的原则，以保证参与合作的伙伴企业都有利可图。

　　其次，要有开放性和学习能力，以开放的姿态去互相接纳，以强大的学习能力去学习别人的优势和长处。实践证明，合作各方之间相互的参观访问、共同的研发团队、共同的技术培训都是相互学习的机会，这有助于成员之间对经营理念的认同、对制度和规范的遵守。

　　第三，遵循“合理过渡”原则；合理控制技术信息的流动；保护合作各方的技术资产，这对于技术合作型的合作模式或联盟组织的管理尤其重要。

　　第四，企业要从观念和结构上进行改变，建立起良好的合作信任机制。依靠评审规范可以建立和维护合作企业之间的信任关系。评审规范包括激励和约束机制，在合作、投资下取得的经济效益和无形资产能有效地激励合作成员，有利于信任的维持和提升，同时，高科技战略联盟成员企业间能否实现收益的公平合理分配是巩固信任的保证，所以，除了通过法律手段对违约行为进行约束以外，成员企业要提高合作的欺骗成本，提高退出壁垒，即如果企业放弃合作或联盟关系，那么其某些资产，如场所资产、人力资本资产和商誉资产都将受到很大的损失，企业会因自己的机会主义行为受到惩罚，这将促使长期合作关系的稳定发展。